北京中醫協會的工作是協助政府制定和實施行業規范、建立健全中醫醫療質量評估體系、加強中醫醫師考試和注冊管理等，推進首都中醫事業的發展；積極開展調研，傾聽行業呼聲和建議，為政府進一步發展中醫事業出謀劃策；反映中醫行業的意愿，維護行業的合法權益，努力營造和諧有序的中醫發展環境和中醫醫療秩序，促進中醫更好地為人民健康服務。此外，還在宣傳、科技成果推廣和應用、社區與農村衛生服務、專業培訓、交流與合作等方面加大力度，為北京中醫全行業管理體制開創新局面。

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